Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CRIP1P50238 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRIP1P50238 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms