Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSC2P49815 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TSC2P49815 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC2P49815 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC2P49815 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC2P49815 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC2P49815 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC2P49815 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC2P49815 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC2P49815 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC2P49815 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC2P49815 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC2P49815 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC2P49815 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC2P49815 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSC2P49815 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC2P49815 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC2P49815 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC2P49815 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC2P49815 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC2P49815 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC2P49815 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC2P49815 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC2P49815 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC2P49815 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSC2P49815 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC2P49815 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC2P49815 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC2P49815 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC2P49815 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC2P49815 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC2P49815 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC2P49815 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC2P49815 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC2P49815 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC2P49815 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC2P49815 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC2P49815 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSC2P49815 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSC2P49815 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC2P49815 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC2P49815 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC2P49815 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC2P49815 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC2P49815 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC2P49815 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC2P49815 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC2P49815 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSC2P49815 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSC2P49815 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC2P49815 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC2P49815 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC2P49815 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC2P49815 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC2P49815 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC2P49815 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC2P49815 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC2P49815 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC2P49815 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC2P49815 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSC2P49815 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSC2P49815 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms