Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CLK1P49759 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CLK1P49759 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CLK1P49759 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CLK1P49759 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms