Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTCFP49711 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTCFP49711 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTCFP49711 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTCFP49711 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTCFP49711 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTCFP49711 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTCFP49711 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTCFP49711 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTCFP49711 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTCFP49711 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTCFP49711 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTCFP49711 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTCFP49711 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTCFP49711 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CTCFP49711 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTCFP49711 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTCFP49711 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTCFP49711 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTCFP49711 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTCFP49711 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CTCFP49711 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTCFP49711 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CTCFP49711 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CTCFP49711 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTCFP49711 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CTCFP49711 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTCFP49711 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTCFP49711 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTCFP49711 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTCFP49711 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTCFP49711 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTCFP49711 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTCFP49711 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTCFP49711 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CTCFP49711 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTCFP49711 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTCFP49711 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTCFP49711 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTCFP49711 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms