Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK8P49336 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK8P49336 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK8P49336 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK8P49336 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK8P49336 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK8P49336 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK8P49336 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK8P49336 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK8P49336 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK8P49336 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK8P49336 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK8P49336 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK8P49336 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK8P49336 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK8P49336 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK8P49336 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK8P49336 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK8P49336 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK8P49336 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK8P49336 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK8P49336 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDK8P49336 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK8P49336 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK8P49336 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK8P49336 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK8P49336 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK8P49336 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK8P49336 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK8P49336 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK8P49336 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK8P49336 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK8P49336 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK8P49336 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK8P49336 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK8P49336 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK8P49336 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK8P49336 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK8P49336 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK8P49336 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK8P49336 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK8P49336 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK8P49336 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK8P49336 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK8P49336 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK8P49336 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK8P49336 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK8P49336 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK8P49336 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK8P49336 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK8P49336 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK8P49336 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK8P49336 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK8P49336 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK8P49336 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK8P49336 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK8P49336 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK8P49336 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK8P49336 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK8P49336 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK8P49336 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK8P49336 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK8P49336 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK8P49336 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK8P49336 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK8P49336 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK8P49336 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK8P49336 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK8P49336 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK8P49336 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK8P49336 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK8P49336 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK8P49336 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK8P49336 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK8P49336 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK8P49336 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK8P49336 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK8P49336 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK8P49336 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK8P49336 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK8P49336 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK8P49336 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK8P49336 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK8P49336 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK8P49336 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK8P49336 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDK8P49336 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms