Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TGM4P49221 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TGM4P49221 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGM4P49221 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGM4P49221 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGM4P49221 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGM4P49221 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGM4P49221 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGM4P49221 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM4P49221 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM4P49221 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM4P49221 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM4P49221 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM4P49221 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM4P49221 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM4P49221 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM4P49221 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGM4P49221 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM4P49221 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM4P49221 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM4P49221 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM4P49221 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM4P49221 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM4P49221 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM4P49221 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM4P49221 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM4P49221 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM4P49221 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM4P49221 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGM4P49221 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms