Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARCN1P48444 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARCN1P48444 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms