Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA4P43694 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA4P43694 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA4P43694 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA4P43694 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA4P43694 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA4P43694 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GATA4P43694 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA4P43694 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA4P43694 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA4P43694 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA4P43694 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA4P43694 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA4P43694 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA4P43694 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA4P43694 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA4P43694 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA4P43694 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GATA4P43694 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA4P43694 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GATA4P43694 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GATA4P43694 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GATA4P43694 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA4P43694 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA4P43694 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA4P43694 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA4P43694 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA4P43694 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA4P43694 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA4P43694 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA4P43694 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA4P43694 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA4P43694 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA4P43694 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GATA4P43694 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA4P43694 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA4P43694 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA4P43694 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA4P43694 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA4P43694 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA4P43694 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA4P43694 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA4P43694 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA4P43694 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA4P43694 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA4P43694 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GATA4P43694 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms