Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRATP43155 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRATP43155 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRATP43155 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRATP43155 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRATP43155 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRATP43155 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRATP43155 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRATP43155 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRATP43155 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRATP43155 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRATP43155 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRATP43155 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRATP43155 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRATP43155 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRATP43155 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRATP43155 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRATP43155 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRATP43155 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRATP43155 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRATP43155 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRATP43155 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRATP43155 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRATP43155 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRATP43155 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRATP43155 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRATP43155 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRATP43155 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRATP43155 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms