Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNPLA4P41247 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA4P41247 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms