Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PTGDSP41222 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTGDSP41222 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms