Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP8P40818 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP8P40818 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP8P40818 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP8P40818 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP8P40818 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP8P40818 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP8P40818 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP8P40818 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP8P40818 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP8P40818 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP8P40818 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP8P40818 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP8P40818 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP8P40818 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP8P40818 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP8P40818 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP8P40818 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP8P40818 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP8P40818 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP8P40818 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP8P40818 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP8P40818 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP8P40818 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms