Protein–RNA interactions for Protein: P40426

PBX3, Pre-B-cell leukemia transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX3P40426 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PBX3P40426 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX3P40426 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX3P40426 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX3P40426 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX3P40426 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX3P40426 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX3P40426 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX3P40426 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX3P40426 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX3P40426 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX3P40426 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX3P40426 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PBX3P40426 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PBX3P40426 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX3P40426 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX3P40426 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX3P40426 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX3P40426 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PBX3P40426 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PBX3P40426 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX3P40426 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX3P40426 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX3P40426 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX3P40426 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX3P40426 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX3P40426 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX3P40426 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX3P40426 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX3P40426 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PBX3P40426 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX3P40426 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX3P40426 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX3P40426 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX3P40426 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX3P40426 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX3P40426 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX3P40426 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PBX3P40426 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PBX3P40426 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX3P40426 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX3P40426 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX3P40426 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX3P40426 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX3P40426 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PBX3P40426 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms