Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX2P40425 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX2P40425 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX2P40425 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX2P40425 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX2P40425 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX2P40425 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX2P40425 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX2P40425 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PBX2P40425 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PBX2P40425 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PBX2P40425 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PBX2P40425 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PBX2P40425 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX2P40425 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX2P40425 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX2P40425 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX2P40425 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX2P40425 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX2P40425 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX2P40425 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX2P40425 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX2P40425 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX2P40425 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PBX2P40425 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PBX2P40425 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms