Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT2P35908 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT2P35908 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT2P35908 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT2P35908 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KRT2P35908 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT2P35908 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT2P35908 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT2P35908 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT2P35908 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT2P35908 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT2P35908 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT2P35908 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT2P35908 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT2P35908 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT2P35908 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT2P35908 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KRT2P35908 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KRT2P35908 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT2P35908 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT2P35908 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT2P35908 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT2P35908 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT2P35908 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT2P35908 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT2P35908 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT2P35908 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT2P35908 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT2P35908 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KRT2P35908 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KRT2P35908 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT2P35908 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT2P35908 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT2P35908 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT2P35908 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT2P35908 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT2P35908 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT2P35908 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT2P35908 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT2P35908 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT2P35908 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT2P35908 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT2P35908 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT2P35908 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT2P35908 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT2P35908 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT2P35908 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT2P35908 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT2P35908 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT2P35908 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT2P35908 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT2P35908 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT2P35908 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT2P35908 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT2P35908 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms