Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTPN7P35236 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PTPN7P35236 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms