Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BMI1P35226 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BMI1P35226 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BMI1P35226 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
BMI1P35226 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
BMI1P35226 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BMI1P35226 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMI1P35226 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMI1P35226 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMI1P35226 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMI1P35226 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMI1P35226 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BMI1P35226 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms