Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR1P32246 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR1P32246 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCR1P32246 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR1P32246 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR1P32246 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR1P32246 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR1P32246 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR1P32246 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR1P32246 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR1P32246 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR1P32246 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR1P32246 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR1P32246 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR1P32246 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR1P32246 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR1P32246 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR1P32246 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR1P32246 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR1P32246 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR1P32246 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR1P32246 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR1P32246 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR1P32246 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR1P32246 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR1P32246 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR1P32246 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR1P32246 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR1P32246 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR1P32246 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR1P32246 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR1P32246 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR1P32246 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR1P32246 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR1P32246 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCR1P32246 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR1P32246 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR1P32246 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR1P32246 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR1P32246 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR1P32246 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR1P32246 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR1P32246 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR1P32246 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR1P32246 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR1P32246 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR1P32246 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCR1P32246 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCR1P32246 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR1P32246 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCR1P32246 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR1P32246 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCR1P32246 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms