Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXC13P31276 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HOXC13P31276 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXC13P31276 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms