Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ECHS1P30084 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ECHS1P30084 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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