Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCAP28676 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCAP28676 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCAP28676 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCAP28676 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCAP28676 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCAP28676 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCAP28676 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCAP28676 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCAP28676 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCAP28676 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCAP28676 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GCAP28676 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCAP28676 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCAP28676 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GCAP28676 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCAP28676 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCAP28676 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCAP28676 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCAP28676 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCAP28676 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCAP28676 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GCAP28676 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCAP28676 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCAP28676 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCAP28676 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCAP28676 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCAP28676 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCAP28676 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GCAP28676 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCAP28676 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCAP28676 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCAP28676 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GCAP28676 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCAP28676 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms