Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX2P28328 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX2P28328 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX2P28328 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX2P28328 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX2P28328 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX2P28328 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX2P28328 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX2P28328 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX2P28328 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX2P28328 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX2P28328 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX2P28328 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PEX2P28328 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX2P28328 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX2P28328 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX2P28328 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX2P28328 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX2P28328 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX2P28328 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX2P28328 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX2P28328 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX2P28328 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX2P28328 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX2P28328 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PEX2P28328 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX2P28328 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX2P28328 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX2P28328 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX2P28328 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX2P28328 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX2P28328 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX2P28328 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX2P28328 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX2P28328 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX2P28328 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX2P28328 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PEX2P28328 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PEX2P28328 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PEX2P28328 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PEX2P28328 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX2P28328 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX2P28328 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX2P28328 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX2P28328 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX2P28328 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX2P28328 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX2P28328 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX2P28328 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX2P28328 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX2P28328 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PEX2P28328 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms