Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA1P25391 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LAMA1P25391 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA1P25391 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
LAMA1P25391 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LAMA1P25391 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LAMA1P25391 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms