Protein–RNA interactions for Protein: P20849

COL9A1, Collagen alpha-1(IX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A1P20849 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COL9A1P20849 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COL9A1P20849 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms