Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATP4AP20648 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP4AP20648 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms