Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TFE3P19532 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFE3P19532 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFE3P19532 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFE3P19532 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFE3P19532 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TFE3P19532 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFE3P19532 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFE3P19532 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFE3P19532 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFE3P19532 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFE3P19532 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFE3P19532 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFE3P19532 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFE3P19532 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TFE3P19532 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFE3P19532 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFE3P19532 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFE3P19532 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFE3P19532 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TFE3P19532 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFE3P19532 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFE3P19532 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFE3P19532 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFE3P19532 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TFE3P19532 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TFE3P19532 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFE3P19532 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFE3P19532 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFE3P19532 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFE3P19532 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFE3P19532 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFE3P19532 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFE3P19532 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFE3P19532 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TFE3P19532 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFE3P19532 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFE3P19532 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TFE3P19532 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TFE3P19532 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TFE3P19532 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFE3P19532 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TFE3P19532 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFE3P19532 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFE3P19532 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFE3P19532 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFE3P19532 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFE3P19532 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TFE3P19532 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms