Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG1P18858 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG1P18858 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG1P18858 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG1P18858 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LIG1P18858 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG1P18858 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG1P18858 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG1P18858 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG1P18858 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG1P18858 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG1P18858 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG1P18858 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG1P18858 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG1P18858 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LIG1P18858 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LIG1P18858 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LIG1P18858 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LIG1P18858 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
LIG1P18858 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LIG1P18858 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG1P18858 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG1P18858 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG1P18858 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG1P18858 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG1P18858 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG1P18858 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG1P18858 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LIG1P18858 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LIG1P18858 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LIG1P18858 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LIG1P18858 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LIG1P18858 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIG1P18858 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LIG1P18858 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms