Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF3P18847 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF3P18847 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF3P18847 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF3P18847 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF3P18847 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF3P18847 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF3P18847 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF3P18847 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF3P18847 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF3P18847 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF3P18847 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ATF3P18847 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
ATF3P18847 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATF3P18847 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATF3P18847 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ATF3P18847 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATF3P18847 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATF3P18847 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ATF3P18847 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF3P18847 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF3P18847 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF3P18847 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF3P18847 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF3P18847 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF3P18847 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF3P18847 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF3P18847 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF3P18847 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF3P18847 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF3P18847 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ATF3P18847 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ATF3P18847 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF3P18847 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF3P18847 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF3P18847 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF3P18847 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF3P18847 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF3P18847 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF3P18847 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF3P18847 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ATF3P18847 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ATF3P18847 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATF3P18847 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATF3P18847 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATF3P18847 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATF3P18847 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATF3P18847 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATF3P18847 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ATF3P18847 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ATF3P18847 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATF3P18847 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATF3P18847 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ATF3P18847 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ATF3P18847 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATF3P18847 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATF3P18847 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATF3P18847 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATF3P18847 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATF3P18847 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ATF3P18847 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ATF3P18847 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms