Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPI1P17947 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPI1P17947 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPI1P17947 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPI1P17947 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPI1P17947 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPI1P17947 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPI1P17947 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPI1P17947 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPI1P17947 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPI1P17947 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPI1P17947 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPI1P17947 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPI1P17947 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPI1P17947 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPI1P17947 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPI1P17947 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPI1P17947 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPI1P17947 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPI1P17947 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPI1P17947 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPI1P17947 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPI1P17947 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPI1P17947 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms