Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN2P17655 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPN2P17655 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms