Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJA1P17302 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJA1P17302 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJA1P17302 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJA1P17302 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJA1P17302 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA1P17302 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA1P17302 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA1P17302 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA1P17302 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA1P17302 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA1P17302 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA1P17302 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GJA1P17302 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA1P17302 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA1P17302 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA1P17302 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA1P17302 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA1P17302 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA1P17302 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA1P17302 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA1P17302 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA1P17302 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA1P17302 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA1P17302 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA1P17302 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJA1P17302 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJA1P17302 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms