Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD46P15529 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD46P15529 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD46P15529 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD46P15529 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD46P15529 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD46P15529 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD46P15529 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD46P15529 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD46P15529 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD46P15529 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD46P15529 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CD46P15529 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD46P15529 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD46P15529 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD46P15529 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD46P15529 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD46P15529 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD46P15529 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD46P15529 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD46P15529 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD46P15529 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD46P15529 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD46P15529 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD46P15529 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CD46P15529 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CD46P15529 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CD46P15529 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CD46P15529 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CD46P15529 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms