Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPBP14678 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNRPBP14678 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms