Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ITGA4P13612 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ITGA4P13612 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms