Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD8P13378 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD8P13378 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms