Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COL11A1P12107 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COL11A1P12107 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COL11A1P12107 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms