Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CYP2C9P11712 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CYP2C9P11712 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms