Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ESRRAP11474 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ESRRAP11474 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms