Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMIGD3P0DMS9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMIGD3P0DMS9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms