Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
C8orf88P0DMB2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
C8orf88P0DMB2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms