Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC172P0C7W6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC172P0C7W6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms