Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP1P09874 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP1P09874 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP1P09874 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PARP1P09874 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PARP1P09874 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP1P09874 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP1P09874 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP1P09874 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP1P09874 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP1P09874 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP1P09874 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP1P09874 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP1P09874 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP1P09874 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP1P09874 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP1P09874 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP1P09874 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP1P09874 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP1P09874 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP1P09874 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP1P09874 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP1P09874 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PARP1P09874 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP1P09874 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP1P09874 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP1P09874 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP1P09874 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP1P09874 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP1P09874 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP1P09874 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP1P09874 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP1P09874 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PARP1P09874 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP1P09874 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PARP1P09874 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP1P09874 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP1P09874 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP1P09874 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP1P09874 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP1P09874 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP1P09874 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP1P09874 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP1P09874 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP1P09874 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP1P09874 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP1P09874 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP1P09874 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PARP1P09874 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PARP1P09874 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP1P09874 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP1P09874 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP1P09874 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP1P09874 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP1P09874 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP1P09874 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP1P09874 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP1P09874 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP1P09874 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP1P09874 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP1P09874 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PARP1P09874 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP1P09874 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP1P09874 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP1P09874 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PARP1P09874 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms