Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIL1P09327 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VIL1P09327 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIL1P09327 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIL1P09327 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIL1P09327 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIL1P09327 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VIL1P09327 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIL1P09327 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIL1P09327 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIL1P09327 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIL1P09327 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIL1P09327 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VIL1P09327 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIL1P09327 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIL1P09327 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIL1P09327 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIL1P09327 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIL1P09327 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIL1P09327 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIL1P09327 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIL1P09327 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIL1P09327 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VIL1P09327 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIL1P09327 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIL1P09327 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIL1P09327 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIL1P09327 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIL1P09327 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VIL1P09327 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
VIL1P09327 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
VIL1P09327 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VIL1P09327 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
VIL1P09327 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIL1P09327 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIL1P09327 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIL1P09327 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIL1P09327 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIL1P09327 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIL1P09327 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIL1P09327 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIL1P09327 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIL1P09327 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIL1P09327 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIL1P09327 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VIL1P09327 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VIL1P09327 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
VIL1P09327 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIL1P09327 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIL1P09327 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIL1P09327 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIL1P09327 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIL1P09327 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIL1P09327 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIL1P09327 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIL1P09327 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIL1P09327 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIL1P09327 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIL1P09327 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIL1P09327 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
VIL1P09327 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VIL1P09327 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VIL1P09327 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VIL1P09327 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
VIL1P09327 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VIL1P09327 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
VIL1P09327 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIL1P09327 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIL1P09327 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIL1P09327 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
VIL1P09327 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
VIL1P09327 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms