Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CYP3A4P08684 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CYP3A4P08684 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms