Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI1P08151 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI1P08151 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI1P08151 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI1P08151 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI1P08151 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI1P08151 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI1P08151 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GLI1P08151 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI1P08151 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI1P08151 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI1P08151 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI1P08151 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI1P08151 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI1P08151 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI1P08151 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI1P08151 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI1P08151 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI1P08151 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI1P08151 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GLI1P08151 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI1P08151 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI1P08151 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI1P08151 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI1P08151 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI1P08151 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI1P08151 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI1P08151 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI1P08151 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI1P08151 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI1P08151 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI1P08151 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI1P08151 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI1P08151 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI1P08151 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI1P08151 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI1P08151 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI1P08151 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI1P08151 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI1P08151 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI1P08151 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI1P08151 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI1P08151 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI1P08151 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI1P08151 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI1P08151 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI1P08151 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI1P08151 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI1P08151 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI1P08151 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI1P08151 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLI1P08151 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLI1P08151 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLI1P08151 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms