Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSLP07711 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSLP07711 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSLP07711 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSLP07711 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSLP07711 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSLP07711 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSLP07711 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSLP07711 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSLP07711 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSLP07711 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSLP07711 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSLP07711 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSLP07711 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSLP07711 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSLP07711 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSLP07711 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSLP07711 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSLP07711 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSLP07711 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSLP07711 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSLP07711 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSLP07711 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSLP07711 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSLP07711 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSLP07711 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSLP07711 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSLP07711 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSLP07711 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSLP07711 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSLP07711 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms