Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
APOA4P06727 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
APOA4P06727 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA4P06727 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA4P06727 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA4P06727 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA4P06727 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA4P06727 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA4P06727 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA4P06727 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA4P06727 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
APOA4P06727 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOA4P06727 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA4P06727 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA4P06727 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOA4P06727 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA4P06727 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA4P06727 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA4P06727 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA4P06727 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA4P06727 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA4P06727 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA4P06727 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOA4P06727 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOA4P06727 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOA4P06727 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOA4P06727 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms