Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
APOC3P02656 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC3P02656 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC3P02656 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC3P02656 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC3P02656 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC3P02656 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC3P02656 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC3P02656 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC3P02656 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
APOC3P02656 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC3P02656 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC3P02656 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
APOC3P02656 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOC3P02656 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOC3P02656 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOC3P02656 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOC3P02656 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOC3P02656 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms