Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPTA1P02549 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms