Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZBED1O96006 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZBED1O96006 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
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